Antibody Analysis
from Sequence
to Structure

全流程抗体序列分析平台 — 从序列输入到3D结构预测、人源化设计与纳米抗体工程,一站式完成

A comprehensive antibody engineering platform covering sequence analysis, CDR extraction, humanization design, 3D structure prediction, and nanobody engineering.

Antibody

核心功能 Core Features

序列分析

Sequence Analysis

批量分析100条抗体序列,自动提取VH/VL、CDR区域检测、风险位点识别

3D结构预测

Structure Prediction

ImmuneBuilder深度学习模型,电荷表面与疏水性可视化

抗体人源化

Humanization

CDR移植设计,种系框架匹配,Vernier区分析与免疫原性评估

纳米抗体设计

Nanobody Design

VHH专用人源化,保留FR2标志残基,纳米抗体结构预测

抗体重构

Reformatter

65种抗体形式,自动计算分子量和消光系数

Seq

专利序列提取

Patent Seq Extraction

从专利PDF文档中智能提取抗体序列,自动识别VH/VL/CDR区域并批量导入分析

Fc工程化改造

Fc Engineering

基于文献的Fc区突变设计,涵盖效应功能增强、CDC增强、Fc沉默、半衰期延长等5大类45种突变方案

高级分析

Advanced Analysis

MSA多序列比对、序列Logo、残基频率热图

AbAnalyzer Pro © 2024-2026 · Powered by ImmuneBuilder & 3Dmol.js

AbAnalyzer Pro

序列数 Sequences: 0/100

点击"添加序列"开始
Click "+ 添加序列" to begin

请先在"序列输入"页面输入序列并运行分析
Enter sequences and run analysis first

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参数设置 Parameters

选择目标重链并点击生成
Select target HC and click Generate

突变输入 Mutation Input 格式 Format: XnnnY (e.g. L234A)

输入突变并点击应用
Enter mutations and click Apply

序列输入 Sequence Input

设计参数 Design Parameters

选择格式并输入序列后点击生成
Select format, enter sequences, and click Generate

65种抗体格式参考 · 65 Antibody Format Reference

# 格式 Format 结构 Structure 特异性 Spec. 价数 Val. 组成 Composition 是否含Fc Has Fc

选择突变 Select Mutations 可跨类别组合选择 Multi-select across categories

选择序列和突变,然后点击「应用突变」
Select sequence and mutations, then click "Apply Mutations"

Fc工程原理 How it works:
  • 基于EU编号系统定位恒定区突变位点
  • 支持5类功能突变:增强效应、CDC增强、FcγRIIB激动、效应沉默、半衰期延长
  • 可跨类别组合突变,自动检测位点冲突
  • Locate mutation sites using EU numbering system
  • 5 functional categories: Enhanced Effector, CDC, Agonism, Fc Silencing, Half-life
  • Cross-category combination with automatic conflict detection

Ref: Liu et al., Antibodies 2020, 9, 64

选择一条已分析的序列或手动输入VH/VL,然后点击「运行人源化」
Select an analyzed sequence or enter VH/VL manually, then click "Run Humanization"

输入VHH序列并点击「运行人源化」
Enter VHH sequence and click "Run Humanization"

或手动输入序列 Or enter sequences manually

选择一条序列并点击「预测结构」,或上传PDB文件进行3D可视化
Select a sequence and click "Predict Structure", or upload a PDB file for 3D visualization

Structure Prediction
  • 使用ImmuneBuilder (ABodyBuilder2) 进行抗体专用结构预测 (1-3分钟)
  • 支持VH+VL配对预测,抗体精度优于通用蛋白预测
  • CDR区域在3D结构上以不同颜色标注
  • 支持Cartoon / Stick / Surface三种显示模式
  • 可下载PDB文件用于进一步分析
  • Uses ImmuneBuilder (ABodyBuilder2) for antibody-specific prediction (1-3min)
  • Supports paired VH+VL prediction with superior antibody accuracy
  • CDR regions highlighted in distinct colors on 3D structure
  • Cartoon / Stick / Surface rendering modes
  • Download PDB files for further analysis

选择数据来源和链类型,然后运行比对
Select data source and chain type, then run alignment

选择数据来源,生成残基频率热图
Select data source, then generate residue frequency heatmap

PDF

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支持文本型和扫描/图像型专利PDF(USPTO / EPO / WIPO / CNIPA)

提取选项 Extraction Options