序列输入 Sequence Input
输入抗体序列进行分析 · Enter antibody sequences for analysis
点击"添加序列"开始
Click "+ 添加序列" to begin
V域分析 V Domain Analysis
可变域序列分析与风险评估 · Variable domain analysis & liability assessment
请先在"序列输入"页面输入序列并运行分析
Enter sequences and run analysis first
C域分析 C Domain Analysis
恒定域分析 · Constant domain analysis
请先在"序列输入"页面输入序列并运行分析
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CDR提取 CDR Extraction
三种编号方案的CDR序列 · CDR sequences across numbering schemes
请先在"序列输入"页面输入序列并运行分析
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嵌合工具 Chimerization Tool
替换恒定域创建嵌合抗体 · Swap constant domains to create chimeric antibodies
参数设置 Parameters
选择目标重链并点击生成
Select target HC and click Generate
突变工具 Mutation Tool
在人IgG重链中引入点突变 · Introduce point mutations into human IgG heavy chains
突变输入 Mutation Input 格式 Format: XnnnY (e.g. L234A)
输入突变并点击应用
Enter mutations and click Apply
重构工具 Reformatter
将可变域重构为65种抗体格式 · Reformat variable domains into 65 antibody formats
序列输入 Sequence Input
设计参数 Design Parameters
选择格式并输入序列后点击生成
Select format, enter sequences, and click Generate
65种抗体格式参考 · 65 Antibody Format Reference
| # | 格式 Format | 结构 Structure | 特异性 Spec. | 价数 Val. | 组成 Composition | 是否含Fc Has Fc |
|---|
抗体人源化 Antibody Humanization
基于Sapiens深度学习模型的人源化设计 · Deep learning-based humanization powered by Sapiens
选择一条已分析的序列或手动输入VH/VL，然后点击「运行人源化」
Select an analyzed sequence or enter VH/VL manually, then click "Run Humanization"
- Sapiens方法：基于200万条人源抗体序列训练的深度学习模型，上下文感知地预测每个位置最可能的人源残基
- CDR Grafting方法：从输入序列中提取CDR，移植到最相似的人源种系框架上
- 阈值越高，人源化程度越保守（保留更多原始残基）
- Sapiens: Deep learning model trained on 2M human antibody sequences, context-aware prediction of human residues
- CDR Grafting: Extract CDRs from input and graft onto best-matching human germline frameworks
- Higher threshold = more conservative humanization (retains more original residues)
纳米抗体人源化 Nanobody Humanization (Llamanade)
输入VHH序列并点击「运行人源化」
Enter VHH sequence and click "Run Humanization"
3D结构预测 Structure Prediction
选择一条序列并点击「预测结构」，或上传PDB文件进行3D可视化
Select a sequence and click "Predict Structure", or upload a PDB file for 3D visualization
- 使用ImmuneBuilder (ABodyBuilder2) 进行抗体专用结构预测 (1-3分钟)
- 支持VH+VL配对预测，抗体精度优于通用蛋白预测
- CDR区域在3D结构上以不同颜色标注
- 支持Cartoon / Stick / Surface三种显示模式
- 可下载PDB文件用于进一步分析
- Uses ImmuneBuilder (ABodyBuilder2) for antibody-specific prediction (1-3min)
- Supports paired VH+VL prediction with superior antibody accuracy
- CDR regions highlighted in distinct colors on 3D structure
- Cartoon / Stick / Surface rendering modes
- Download PDB files for further analysis
高级分析 Advanced Analysis
多序列比对、序列Logo与热图可视化 · MSA, Sequence Logo & Heatmap
选择数据来源和链类型，然后运行比对
Select data source and chain type, then run alignment
选择数据来源，生成序列Logo
Select data source, then generate sequence logo
选择数据来源，生成残基频率热图
Select data source, then generate residue frequency heatmap
INN抗体数据库 INN Antibodies
599个INN命名的IgG抗体完整序列与分析 · Complete sequences & analysis of 599 INN-designated IgGs
专利序列提取 Patent Sequence Extraction
上传专利PDF，自动识别并提取氨基酸/核酸序列（支持文本型和扫描/图像型PDF，支持单字母和三字母氨基酸编码）
拖拽PDF文件到此处 或
支持文本型和扫描/图像型专利PDF（USPTO / EPO / WIPO / CNIPA）